O livro em si foi escrito quase inteiramente em latim e parece ser algum tipo de coleção de crenças e feitiços mágicos da Renascença, incluindo muitos gráficos, tabelas e códigos secretos, bem como várias passagens sobre encantamentos, astrologia, demonologia, listas de conjurações, mansões lunares e os nomes e genealogias dos anjos. Existem também numerosas referências a outros livros de magia medievais que nem mesmo existem. Embora a maior parte esteja em latim e seja facilmente traduzível, nem tudo é particularmente simples. Muitas palavras são, por razões desconhecidas, escritas ao contrário, e há vários códigos numéricos que Dee não foi capaz de decifrar em seus estudos obsessivos do livro e que na verdade permanecem misteriosos até hoje. Um matemático e pesquisador do livro, Jim Reeds, disse a respeito:
A preocupação do Livro de Soyga com letras e a aritmética do alfabeto escrita invertida semelhante ao hebraico é certamente característica da nova magia cabalística que se tornou popular no século dezesseis, exemplificada pela grande compilação de Agripa de Nettesheim (1486- 1535), e emprestando autoridade tanto do interesse humanista da Renascença na Cabala expresso por figuras como Pico e Reuchlin quanto da suposta antiguidade bíblica da Cabala.
Dee realmente acreditava que o Livro de Soyga continha em suas páginas alguns segredos profundos do universo, e devotou muito de seu tempo estudando-o febrilmente e tentando decodificá-lo, com vários níveis de sucesso. Ele ficou tão desesperado para mergulhar em seus mistérios profundos que até mesmo procurou o conselho de anjos, tentando o contato por meio de vidência e outros métodos. Ele alegaria ter falado com o anjo Uriel sobre o livro, que supostamente lhe disse que tinha sido mostrado a Adão no Jardim do Éden, e que só poderia ser devidamente traduzido e compreendido pelo arcanjo Miguel. Não se sabe se ele obteve mais respostas dos anjos, mas sabemos que Dee permaneceu verdadeiramente obcecado pelo livro até sua morte, sem nunca ter decifrado seus segredos.
Após a morte de Dee, grande parte de sua biblioteca foi saqueada e perdida. O Livro de Soyga desapareceu, e em 1994, a acadêmica Deborah Harkness encontrou dois manuscritos mantidos na Biblioteca Britânica e na Biblioteca Bodleian, sob o título Aldaraia sive Soyga vocor, que provou ser ser, na verdade, cópias do perdido Livro de Soyga. Mesmo nos dias modernos, seu verdadeiro significado provaria ser ilusório. Embora Reeds tenha conseguido decifrar o algoritmo de construção, a fórmula matemática e as palavras de código usadas na geração das tabelas numéricas, mesmo encontrando erros cometidos pelo autor ou autores do livro, ainda não se sabe o que isso realmente significa ou qual é o seu significado. Reed diria sobre seu próprio fascínio pelo manuscrito:
Sabemos que as tabelas do Livro de Soyga despertaram o interesse de John Dee, como pode ser visto no diálogo com Uriel. O livro é preenchido com uma seleção aleatória e sem sentido de letras, é um criptograma com um significado oculto de "texto simples", que poderia pelo menos em princípio ser recuperado por criptoanálise, ou havia alguma outra estrutura ou padrão para eles? O tratado no Livro de Soyga que discute as tabelas, Liber Radiorum, tem uma série de parágrafos mencionando as palavras de código para vinte e três das tabelas, junto com sequências de números que estão em relação desconhecida com as palavras.
Muitas pessoas têm trabalhado para tentar descobrir os mistérios do Livro de Soyga e, no entanto, ele permanece tão misterioso como outrora. O que devemos fazer com este texto, quem o escreveu e com que propósito? Ele contém algumas pistas importantes sobre a natureza de nossa própria realidade ou é apenas uma brincadeira da parte dos autores? John Dee parecia pensar que era um manuscrito de extrema importância, mas talvez nunca saibamos o que isso implica.